呼吸系统疾病主要的实验室检查，分为以下六个途径：
第一、各种类型的血液检查，包括外周血的血象、生化、电解质、动脉血气分析、血清抗体、血培养、肿瘤标志物、自身免疫系统疾病的免疫指标等。
第二、对呼吸道分泌物的检查，包括痰液的涂片、培养。
第三、胸腔积液的检查，可以是胸腔积液的常规、生化、脱落细胞、培养等。
第四、纤维支气管镜的活检、刷检、灌洗液的检查。
第五、经皮肺穿活检、经纤维支气管镜活检。
第六、肺功能测定，对肺功能的通气功能、弥散功能、肺的容量、通气储备，都可以通过肺功能测定，对肺功能作出客观、定量的判断。
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