不适宜做无痛肠镜的人群，有以下几种：第一、麻醉风险较高的人，包括高龄、急性上呼吸道感染、中度贫血、严重高血压、急性心肌梗塞、新发脑梗塞、肺心病、恶性心律失常、严重打鼾以及严重过敏体质的患者。以上患者在麻醉过程中，容易导致血氧下降、呼吸抑制、心跳停止、昏迷等严重并发症。第二、不适合做肠镜的病人，也不适合做无痛肠镜。包括肛裂、肛周脓肿、肛门严重狭窄的病人，肠镜无法进入。身体极度衰弱、肠梗阻、电解质紊乱的病人，因为不耐受喝泻药，肠镜也没有办法完成。妊娠期的妇女做无痛肠镜容易造成流产，而女性在月经期容易感染。第三、胃肠道穿孔、急性腹膜炎、急性重度溃疡性结肠炎及克罗恩病，腹腔广泛粘连、大量腹水的病人，做肠镜时较困难而且容易发生穿孔。
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