黄连素不是抗生素，又称盐酸小檗碱片，主要有效成分是小檗碱，是一种生物碱，对病原菌只起到微弱的抗菌作用；优势是对肠道的病原菌能起到一定的治疗作用，特别是痢疾杆菌。黄连素在临床上主要用于胃肠道感染，如可以用于治疗感染导致的腹泻和腹部不适。
使用黄连素时需注意，由于其是一种生物碱，容易和含有鞣质的药物发生沉淀，特别是中药类的物质，从而影响药物的治疗效果，同时使用中药的患者需要特别注意。
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