子宫囊肿和子宫肌瘤性质不同，子宫囊肿大多是指子宫颈腺囊肿，绝大多数为子宫颈的生理性变化，并不一定有疾病，是由于子宫颈转换区内鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口或深入腺管，将腺管口堵塞，导致腺体分泌物引流受阻，潴留形成的囊肿或子宫颈局部损伤、子宫颈慢性炎症，使腺管口狭窄，也可以形成子宫颈腺囊肿，通常简单的称之为子宫囊肿，其实位于子宫颈部。
子宫肌瘤是一个疾病，是一种比较常见的良性子宫肿瘤，属于子宫平滑肌瘤，由平滑肌和结缔组织增生而形成。子宫肌瘤大多位于子宫体部，有极少数可能在子宫颈部，但都属于一种疾病。子宫肌瘤按照肌瘤与子宫肌壁的关系，通常分为肌壁间子宫肌瘤、浆膜下子宫肌瘤和黏膜下子宫肌瘤，容易引起月经异常，导致经期延长和经量增多，甚至需要做手术才能够处理。
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