色素痣分为很多颜色，棕色的痣称为色素痣，或者可能是色素性毛表皮痣，都与色素有关。黑色素细胞在胚胎发育时，正常情况下应该移行到表皮的基底层，可是由于发育异常，没有移行到基底层，而是停留在真皮层，最后长出的痣称为色素痣，痣的颜色由黑素颗粒产生色素的多少决定。如果色素较少可能是淡褐色的痣，色素产生较多，可能是棕色痣。
如果毛发比较丰富，又是大片的表现，称为色素性毛表皮痣。痣又有大小之分，有米粒、绿豆、黄豆、蚕豆大小，甚至大片的兽皮痣。兽皮痣是先天性的遗传性色素痣，需要接受手术进行治疗，而色素性毛表皮痣最好也进行手术加上皮瓣移植治疗。
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