益生菌常用的有双歧杆菌四联活菌或地衣芽孢杆菌二联活菌等，这类药物主要用于调节肠道菌群，并没有治疗幽门螺杆菌的功效。治疗幽门螺杆菌的过程中需要使用两种抗生素，比如用阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑等，这类药物会杀灭或抑制肠道的益生菌，会引起肠道的菌群失调，所以，在治疗幽门螺杆菌的过程中需要用肠道益生菌调节抗生素引起的肠道菌群失调，所以，在治疗过程中用益生菌主要是有补充或补益作用，但本身没有治疗幽门螺杆菌的效果。
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