首先要清楚肛门镜大概多长，肛门镜的长度大概在6-8cm，所以如果是用肛门镜做检查，基本上只能看到肛门跟直肠，直肠以下10cm左右的部分。只能看到肛门跟直肠10cm以下的部分，这时可以判断的疾病有痔疮、肛裂、肛周脓肿、肛乳头肥大、肛窦炎以及直肠息肉。目前对于肛门镜来说只能是判断上述相关疾病，如果想要判断更多的疾病，比如结肠或者肠的其它部分，就只能借助电子结肠镜。电子结肠镜与肛门镜的区别就在于电子结肠镜可以看到整个大肠，从盲肠、阑尾、结肠都可以看到，不仅只看到肛门部分，还可以看到整个大肠。所以只要是肛门镜能够看到的部分，电子结肠镜全部都可以看到，所以如果只是肛门一小节的病变就可以做肛门镜；如果想要看其他方面肠的问题就需要做电子结肠镜。
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