衣原体是一类病原微生物，这里病原微生物感染人之后，主要是在细胞内寄生，它们都有细胞壁。衣原体可以指鹦鹉热衣原体或者肺炎衣原体，感染人主要是导致呼吸道的感染，有可能表现为严重的肺炎，但也有可能是比较轻的上呼吸道感染，甚至没有特别明显的症状。另外一种衣原体叫做沙眼衣原体，除了感染人导致沙眼之外，也可以出现包涵体性结膜炎。这两种疾病主要都是结膜的滤泡形成，以及其他的症状，沙眼的患者还可以有明显的眼部的瘙痒。沙眼衣原体也有可能导致性病淋巴肉芽肿，男性的腹股沟淋巴结可以出现肿大，形成包块，与周围的组织粘连，甚至液化、破溃，形成瘘管，女性大多是在直肠周围的淋巴结出现这样的病变。沙眼衣原体也有可能造成泌尿生殖道的感染，出现非淋菌性尿道炎，男性可以表现为尿频、尿急，女性也可以表现为这些症状。女性在围生期感染，甚至还能够导致新生儿出现这样的感染。
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