做脑室腹腔引流术后大部分患者的脑积水会得到明显的改善，患者的症状会明显减轻或者消失，预后良好。但是有少部分患者术后会出现一些并发症和后遗症，比如脑积水引流过度出现脑萎缩，患者会出现智力低下、行为异常、性格的改变，甚至出现缄默、精神症状等。如果引流管出现堵塞，患者的脑积水会复发，患者会出现头痛、恶心、呕吐、行走不稳等脑积水的症状。
如果出现了感染，会形成颅内的脓肿，严重时会危及生命，感染后也需要拔除引流管，否则感染会迁移不愈。还有腹腔的并发症，引流管一端要放在腹腔里，容易导致肠穿孔、肠粘连、肠梗阻等并发症。
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