复发性口腔溃疡的病因是多方面的。现代医学认为，复发性口腔溃疡首先与免疫有着很密切的关系，有的患者表现为免疫缺陷，有的患者表现为自身免疫反应。复发性口腔溃疡在临床中还有明显的家族遗传倾向，父母一方或者双方如果患有复发性口腔溃疡，子女比普通人容易患病。复发性口腔溃疡的发作，还有一些疾病和症状有关，比如消化道系统的疾病，胃溃疡、十二指肠溃疡、结肠炎等，都与口腔溃疡的发作有关。此外，一些不良习惯，比如偏食、睡眠不足、过度疲劳，也是复发性口腔溃疡的病因；还有消化不良、全身状态较差，随着机体免疫力下降，口腔溃疡会频繁出现。
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