由于谷氨酰转肽酶在肝内主要存在于肝内胆管上皮和肝细胞当中，当出现肝外胆管和肝内梗阻时，就会造成谷氨酰转肽酶随胆汁反流入血，这时血清谷氨酰转肽酶会升高。
除了肝脏外，肾、肺、睾丸、心、脑、肌肉也会含有谷氨酰转肽酶，因此肾盂肾炎、代谢性肺炎、乙型脑炎、心肌炎、胆囊炎血、吸虫病等都会造成谷氨酰转肽酶升高，药物过敏以及药源性、中毒性肝损伤也会造成谷氨酰转肽酶升高。如果患有胆囊以及胰腺疾病、胆管阻塞，因为谷氨酰转肽酶从胆管排泄，所以以上疾病也可以导致谷氨酰转肽酶升高。妊娠中毒症、妊娠急性脂肪肝等，甚至正常的妊娠，有时也会导致谷氨酰转肽酶升高。
