直肠癌病因尚未明确，可能和下列因素有关。首先是环境因素，在各种环境因素中，以饮食因素最为重要，直肠癌的发病率和食物中的高脂肪有正向关系。在动物脂肪和蛋白质摄入过高、食物纤维摄入不足的人群中，直肠癌发病率明显增高。另外也有可能与微量元素缺乏、生活习惯改变有一定关系。其次，直肠癌的易感性与遗传因素也有一定关系。第三就是直肠腺瘤，直肠腺瘤的发病情况与直肠癌部位一致。据统计，具有一个腺瘤的病人，其直肠癌的发病率比无腺瘤者高五倍，多个腺瘤者比单个腺瘤者患病的发病率高出一倍。第四就是慢性大肠炎症，大肠癌流行与血吸虫病的流行区域呈正比关系。一般认为，由于血吸虫而导致肠道的炎性改变，其中一部分会发生癌变。肠道的其他慢性炎症也有癌变的可能，比如溃疡性结肠炎，大约有3%至5%的癌变率。
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