昏迷的鉴别诊断主要包括两大方面：
第一大方面，是昏迷与易被误认为昏迷的疾病进行鉴别，比如闭锁综合征是由于运动传出通路受损而引起的失运动状态，病人是意识清醒的，眼球只能上下运动，其他运动功能丧失，病人不是昏迷状态，见于急性脑血管病、感染肿瘤、脱髓鞘疾病等引起，意志缺乏症患者于清醒状态，运动功能存在，缺乏运动的始动性，出现少语少动，不是昏迷的状态，常常见于双侧额叶的病变，木僵的人表现为不语、不动、不吃、不喝，对外界刺激缺乏反应，类似昏迷，但这不是真正的昏迷，见于精神分裂症的木僵状态。
第二大方面，主要是针对昏迷的病因诊断方面进行鉴别，根据昏迷伴发的症状和体征进行病因方面的提示，比如常见的脑炎，脑膜炎、蛛网膜下腔出血、大面积脑梗死、脑外伤、高血压脑病、药物中毒以及癫痫发作或者甲状腺功能减退以及甲状腺功能亢进、垂体危象等等情况。
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