腰椎间盘突出症的鉴别诊断，常可以和以下疾病相鉴别：
第一、腰肌劳损：中年人多发，与长期保持一种劳动姿势有关，以无明显诱因的慢性疼痛为主要症状，腰痛为酸胀痛，休息后可以缓解，在疼痛期往往有固定的压痛点，压痛点进行叩击时，疼痛反而会减轻。直腿抬高试验阴性，没有下肢神经痛的表现，行CT、磁共振等检查，没有腰椎间盘突出的影像学表现。
第二、梨状肌综合征：主要表现为臀部和下肢的疼痛，症状的出现和加重主要与运动有关，休息后可以明显缓解。
第三、腰椎管狭窄症：患者多以下腰痛，马尾神经、腰神经受压的症状为主，以神经源性间歇性跛行为主要特点，症状特点和影像学检查是鉴别的重要依据。
第四、脊柱结核：既往会出现不明原因的发热、盗汗、乏力病史，有体重下降等中毒症状，夜间疼痛或持续性疼痛明显，影像学检查可见到椎间隙破坏为主要表现，可形成后凸畸形或者颈椎病变节段的序列差等。
第五、脊柱肿瘤：患者会出现腰部明显的疼痛，而且呈持续性、渐进性的加重，可能会伴有运动感觉的障碍，影像学上可能见椎体的骨质破坏，肿瘤组织也可能压迫椎管内的神经，而出现下肢的放射性疼痛，但在影像学上，与腰椎间盘突出有明显的区别。
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