因为脊索瘤细胞血小板源性生长因子受体α和β表达丰富，所以，可以采用酪氨酸激酶抑制剂伊马替尼进行多发性脊索瘤的治疗，该药能够缓解脊索瘤的不适症状，使瘤体密度下降、血供减少甚至出现液化。另外一种药物，舒尼替尼也可以降低肿瘤的密度，有研究表明，该药也可以使44%的脊索瘤患者病情稳定至少16周。以上两种药物的应用均已完成临床二期试验，伊马替尼被最新的欧洲肿瘤内科学会临床指南推荐用于控制脊索瘤的进展。但是，对于脊索瘤早期是以手术治疗为主，同时联合放疗。因为脊索瘤容易复发，在治疗过程中一定要定期随访。
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