结膜囊分泌物沙眼衣原体检测阴性，提示病人不存在由衣原体引起的相关感染，但必须提醒您的是衣原体检测阴性，也是不能够完全排除有衣原体感染的可能。比如患者在检测前已经使用红霉素，全身治疗沙眼衣原体，这种情况可以影响检测的结果。
因此，如果衣原体检测结果是阴性的，临床一般会结合病人的病情、影像学表现和临床诊断，会安排您进行复查再次核对。同时，在这种情况下如果病人使用抗生素，临床医生会提示患者在使用抗生素之后，停止一周以上再进行衣原体的检测，这样可靠性更高。
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