对于患者如果查上腹部彩超，提示肝内囊性病变，考虑肝囊肿的可能性较大。对于多发性的肝囊肿，还需要看双肾上有没有肾囊肿的可能性，如果合并有双肾多发的囊肿及肝脏多发囊肿，考虑患者有多囊肾的可能性。这种疾病是遗传性疾病，没有特殊的治疗方式，患者需要定期的观察。
如果肝囊肿或者肾囊肿超过5cm，有一定的不适症状，可以考虑行腹腔镜下囊肿开窗去顶引流术。有些手术意愿不强，身体状况不允许的患者，也可以行超声引导下肝囊肿穿刺引流术，并酌情经导管注入无水酒精进行囊壁的毁损，但有较高的复发率。另外对于普通的肝脏多发性囊肿，或者是单发性囊肿，需要定期的复查上腹部彩超，看患者肝囊肿大小及直径。
此时患者需要和其它的肝脏疾病做鉴别，尤其是对于肝脏的转移性肿瘤，必要的时候需要做上腹部增强CT，及核磁共振检查。看患者有无身体内其他部位肿瘤，转移至肝脏发生的可能性，尤其对于结肠、直肠肿瘤性疾病的患者，排除肿瘤性疾病，如果患者肝囊肿的直径大于5cm，要考虑必要时做腹腔镜下肝囊肿去顶引流术或者行超声引导下肝囊肿穿刺引流。
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