肾盂肾炎的感染途径有四种：上行感染、血行感染、直接感染、淋巴道感染。上行感染是由于病原菌从尿道上行到膀胱，再到输尿管，最后到达肾盂所引起的感染，这种感染约占95%，正常情况下，尿道口定居着少量的细菌，但是它们不致病，只有在性生活、尿路梗阻、医源性操作或者是生殖器感染的时候，可能会导致上行感染的发生。血行感染是病原菌通过血运到达肾脏引起的感染，这种感染一般比较少见，大概不到3%，大部分鉴于患者患有慢性疾病或者是接受免疫抑制剂治疗的患者，这部分患者就是免疫力比较低。直接感染，肾脏周围的器官组织发生感染的时候，病原菌可以直接进入到肾脏，引起肾盂肾炎。淋巴道感染就是盆腔和下腹部的器官发生感染的时候，病原菌可以通过淋巴管、淋巴道来进入到尿道，引起肾盂肾炎，但是一般比较罕见。
