早晨起来感觉肾不舒服，很可能是指肾区不舒服，肾区的不舒服有可能是肾脏的原因，也有可能是肾脏以外肾区器官和组织的原因，最常见的就是皮肤、肌肉以及骨骼的疾病。
皮肤出现了病变，往往还有明确的病史，在皮肤外观上可以进行鉴别诊断，早晨起床突然出现，可能性不大，有可能的是腰肌的病变。腰肌容易出现腰肌劳损，特别是睡硬板床或者睡过软床的时候，可以出现腰肌劳损，这种腰肌劳损在活动后可以加重或者减轻。腰椎出现了病变，最常见的是椎间盘突出或者骨质增生，如果早晨起床出现异常，最有可能是椎间盘突出造成的，需要做腰椎X线片或者CT来进行鉴别诊断。排除了以上的原因，就是肾脏出现了异常，需要排除感染、结石或者积水的情况，如果早晨起来感觉肾脏不舒服，有可能是结石造成的，需要做泌尿系统彩超进行鉴别诊断。
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