治疗乙肝的药物，在临床上包括抗乙肝病毒的药物、保肝降酶的药物以及一些中药。抗病毒的药物有干扰素，包括长效的和短效的，但干扰素的副作用比较大，治愈乙肝的概率又比较低，所以临床上并不是特别常用。临床上比较常用的是口服核苷类似物，虽然存在耐药的风险，但临床上最常用的两种恩替卡韦和替诺福韦，目前产生耐药的概率非常低，但需要长期的口服。另外，保肝降酶的药物，有口服的，也有静脉的，主要是甘草类制剂，包括甘草酸二胺、复方甘草酸苷以及静脉应用的异甘草酸镁注射液。其它的保肝降酶的药物，还有还原型谷胱甘肽，稳定肝细胞膜的多烯磷脂酰胆碱、水飞蓟素的一些制剂。中药在抗肝硬化、抗肝纤维化方面有一定的效果，可以选择鳖甲煎丸治疗肝硬化。
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