孕期卵巢囊肿需根据不同性质采取不同治疗，如果在孕早期发现生理性囊肿，单纯随访即可。如果孕期发现卵巢实性肿块，不排除恶性，需考虑在孕中期手术。孕期同时发现畸胎瘤的患者，也建议在孕中期即3个月后进行手术治疗。
以前的观念是孕期手术尽量不做，怕影响小孩子的发育及继续妊娠的情况，但在临床过程中经常发现妊娠期合并畸胎瘤，合并5-6cm的卵巢囊肿，随着孕周增长、子宫增大，在牵拉过程中可能出现扭转的情况，扭转发生后患者会出现剧烈腹痛，特别是在中晚孕期时，处理会相当棘手，所以在孕中期即3-6个月之间，特别是子宫没有特别大时，可采取腹腔镜微创下将囊肿剥除，避免在更大的孕周出现扭转情况。腹腔镜手术相对较安全，对于妊娠合并卵巢囊肿的患者，特别是畸胎瘤易扭转者，需考虑根据其大小来决定孕中期是否进行手术治疗。
