肾结石形成的原因非常复杂，原因比较多，一般和年龄、性别、种族、遗传、环境因素、饮食、生活习惯和职业都有一定的关系。大致可以分为三个原因，如下：
一、尿液中成分发生改变，比如尿中草酸盐的含量、钙质增加，导致肾结石的发生。
二、一些药可以导致肾结石的发生，比如磺胺类、激素类药物，可以促进肾结石的形成。
三、先天性的因素，比如肾盂、输尿管连接部狭窄，先天性畸形导致尿流不畅，也可以导致肾结石的发生。
四、泌尿系感染，也可以促进结石的形成。
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