首先亚甲炎并不分急性期、慢性期，因为亚急性甲状腺炎是和病毒感染相关的自限性疾病。它在发病之前，往往有一周左右像感冒一样的症状。另外，它可以有四个不同的阶段，比如甲亢期、过渡期、甲减期、恢复期。当然，这四个阶段并不是有明确的区分，最开始病人可以出现发热，体温往往在午后或者晚上发热比较明显，甚至高到39℃。可以出现颈部痛性的包块，颈部的疼痛可以出现游走，也就是由一侧变到另外一侧，疼痛可以放射到下颌部和耳朵。除了发热、疼痛，还可以出现像甲亢一样的症状，比如怕热、多汗、手抖、心慌、情绪的变化。随着病情的进展，甲状腺功能逐渐演变为甲状腺功能减退，也就是血液里的甲状腺激素水平会降低。
如果亚甲炎症状非常明显，很多患者是因为发热待查、颈部疼痛，去发热门诊、呼吸科门诊，有经验的医生帮助患者考虑到亚急性甲状腺炎，亚急性甲状腺炎主要的急性症状就是感染中毒的症状。通过详细的病史的询问、体格检查，有颈部触痛的包块，进行化验发现血沉增快，甲状腺激素水平增高，另外除外其他的感染性疾病。进行甲状腺吸碘率的检查，甲状腺不吸碘，而且甲状腺扫描显影不明显。诊断以后主要的治疗，一个是好好休息，另一个是如果症状严重，会需要糖皮质激素的治疗。亚急性甲状腺炎整个病程往往在两个月左右，很少超过半年。往往这个疾病是自限性的疾病，经过休息也能够痊愈，很少复发，也很少遗留终身性的甲减。
