蛛网膜囊肿在头颅CT上表现为比较均匀一致的低密度影，蛛网膜囊肿被蛛网膜包裹，位于脑部，其内部充满了脑脊液。如果囊肿较小，没有临床症状，囊肿较大时可以对周围产生压迫和占位效应。常见的部位是在枕大池、颞极、松果体等部位，CT上可以在相应部位观测到低密度影，密度比较均匀，周围有明显的分界线。当对周围组织产生占位效应时，可能会使周围组织移位。比如枕大池囊肿可能会压迫到小脑，引起头晕、走路不稳、共济失调等症状。如果是透明隔囊肿，有可能挤压到双侧的侧脑室，引起侧脑室变小或者狭窄。
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