男性支原体、衣原体怎么检查，医院里会有两种检查方式：一种是DNA的检查方式，通过尿道拭子在尿道里面取尿道分泌物，进行支原体、衣原体的DNA的检测；另一种是检测RNA，可以通过留取尿液的标本，进行尿液的支原体、衣原体的RNA检测。其中第二种方法，也就是RNA的检测敏感度更高，更容易检测出支原体或者支原体的阳性，如果检测支原体、衣原体的阳性，需要进行对症的抗生素进行抗感染治疗。
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