男性泌尿系感染需要确定是哪种细菌引起，才能知道吃什么药效果最好。所以用药前需要进行尿液细菌培养，可以发现引起疾病的病菌，然后再用培养出的病菌进行常规药敏定量试验。可以判断出哪种药物对细菌的消灭能力强，从而选择相应的药物治疗疾病。在没有进行尿液细菌培养和药敏定量检测前，可以依据经验用药。由于尿路感染细菌多为大肠杆菌，因此可使用喹诺酮类药物，如盐酸左氧氟沙星、诺氟沙星等，还可以使用氨曲南。还可以通过服用中药的方法进行治疗，可服用清热利湿的药物，如热淋清片、八正散等中成药，对于治疗男性尿路感染效果非常不错，并且不存在细菌耐药的情况。
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