胃肠道间质瘤直径＜2cm，定期观察，不需立即手术。直径＞2cm需要手术。胃肠道间质瘤生物学行为特殊性，手术治疗只需病灶局部切除，不需大范围淋巴结清扫。肿瘤大小、核分裂象、肿瘤原发位置，三个参数决定胃肠道间质瘤的预后，胃肠道间质瘤分为不同复发危险等级，根据不同危险等级决定术后是否进行药物治疗。中低危复发风险，不进行药物治疗，高危复发风险，术后常规药物治疗。
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