慢性鼻窦炎通过规范化治疗，有80%甚至90%的人能够完全控制症状，但是完全控制，不是以后永远不会复发，永远不会出现症状，并不是如此。有时感冒或者不注意，这些症状可反复出现，但是这时再及时治疗，可能又可以完全控制症状。
还有10%-20%的患者慢性鼻窦炎，虽然采取各种治疗方法，都不能将症状做到完全控制，只能做到部分症状控制，甚至无效，这部分患者由于个体因素引起，如囊状纤维化、纤毛不动综合征。另外，嗜酸性粒细胞性鼻窦炎是比较难治性的鼻窦炎，临床上确实存在，这一部分患者需长期随访、长期观察、长期药物治疗。
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