谷酰转肽酶升高对于肝癌并没有特异性。肝癌的主要标记物有甲胎蛋白，甲胎蛋白是诊断肝细胞癌特异性的标志物，阳性率约为70%，现已广泛用于肝癌的普查、诊断、判断治疗效果及预测复发，在排除妊娠和生殖腺胚胎瘤的基础上，甲胎蛋白大于400ng/ml，为诊断肝癌的条件之一。对于逐渐升高不降或大于200ng/ml持续八周，应结合影像学及肝功能变化做综合分析或动态观察。
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