双向情感障碍是心理障碍中比较特殊的一类疾病，且容易误诊。与强迫症、精神分裂症等精神障碍相同，目前发病机制尚未明确。
但研究表明，多与以下几点有关：
1、遗传因素，虽不是遗传病，但遗传率可达85%；
2、神经影像学检查发现情感双向障碍或其他心理障碍患者脑结构、脑功能都发生了明确改变，且人体基本神经递质如五羟色胺、多巴胺、去甲肾上腺素等均发生异常改变；
3、神经内分泌因素，如下丘脑、垂体、肾上腺等出现异常改变。
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