肠镜能检查的疾病相对还是比较多的，首先可以检查结直肠肿瘤，包括结直肠癌、结直肠早癌、结直肠良性肿瘤，比如结直肠息肉。通过结肠镜检查可以发现一些肠道炎症性疾病，比如溃疡性结肠炎、克罗恩病。还可以对一些特殊的病人，比如下消化道出血的病人，做肠镜检查可以明确出血部位，比如毛细血管扩张的出血，还有血管畸形出血，都可以通过肠镜检查，加以明确。现在建议年龄大于40岁以上人群，每年进行常规定期体检，包括肠镜检查，可以早期发现肠道的息肉，并进行治疗，避免息肉发生癌变，降低结直肠癌的发生率。
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