室间隔缺损手术为较常见的先天性心脏病手术，手术风险需进行个体化分析，如出生体重约在3kg的新生儿，手术风险相对较高。首先新生儿的心肌未成熟，其次对麻醉耐受程度和正常儿童不同。
新生儿对医生手术精细度的要求较高，年龄较合适、体重偏大的儿童，可根据病情选择手术方式，如封堵术或开刀手术，因此手术风险相对会比较轻微。根据目前主流数据显示，新生儿室间隔缺损手术的死亡率可控制在1%以内，而年龄较大的儿童行室间隔缺损手术，风险基本接近于0%。
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