1、凡怀疑有食管、胃及十二指肠疾病，经全面检查(包括X线检查)未能确诊者。
2、胸骨后疼痛、烧灼感及吞咽困难，疑有食管疾病者。
3、消化性溃疡，需要胃镜检查随访其愈合情况，鉴别其良恶性者。
4、胃癌和食道癌的普查，胃镜可以提高诊断准确率，发现早期病例，并进行治疗。
5、上消化道胃和食管的息肉及隆起性病变，需行胃镜下治疗并适时跟踪。
6、上消化道48小时内的出血病例，宜进行急诊胃镜，确定病因，有利于采取及时合理的治疗方案。
7、上消化道一些慢性炎症，如慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生或不典型增生，可能需要反复做胃镜进行治疗和随访。
8、胃大切除术后病例，需要适时胃镜检查随访。
9、食道和胃的异物以及其它疾病，可以进行胃镜治疗。
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