治疗幽门螺旋杆菌主要使用四联疗法来进行治疗，四联疗法中有两种是抗生素，抗菌药物选用克拉霉素、阿莫西林、左氧氟沙星、奥硝唑、甲硝唑，这些抗菌药物选择其中的两种。还要选用一种质子泵抑制剂，代表药物有奥美拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑、艾司奥美拉唑。也要选用一种铋剂，比如胶体果胶铋、枸橼酸铋钾等药物来治疗幽门螺旋杆菌。一般治疗的疗程是1个月以上，1个月之后再进行复查。
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