先天性手畸形的原因有母亲怀孕时服用药物、受外界射线辐射、胚胎发育过程中形成畸形。大多数手畸形是先天遗传因素引起的，母亲怀孕过程中应避免服用药物、接触射线，防止出现先天性手部畸形，先天性手畸形对后代有可能遗传，因为先天性手畸形都是在胚胎时期形成畸形，体内留有缺陷的基因，后代也有产生先天性手畸形的情况。
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