强直性脊柱炎的病因及发病机制尚不明确，大多数学者认为其发生与遗传、感染、免疫功能紊乱、内分泌失调等因素有关。
1、遗传因素：目前该病被公认为是一类与人类白细胞抗原B27基因高度相关的遗传性疾病。HLA-B27是最早提出的与AS发病相关基因，研究证实HLA-B27直接参与了AS的发病，是AS的原发关联成分。随着基因研究的深入及科研技术的提高，大量除HLA-B27外的基因被提出也与AS发病相关。
2、免疫因素：自身免疫功能低下与AS相关。AS患者骨、关节及滑膜组织内有大量炎性T细胞、单核-巨噬细胞浸润，存在免疫应答反应。
3、感染因素：目前被提出的与AS发病可能相关的主要有引起上呼吸道感染和肠道感染的肺炎克雷伯菌、沙门菌等肠道寄生G-菌及衣原体等。
有报道外伤、甲状旁腺疾病、内分泌及代谢缺陷等与AS的发生有关。而风、湿、寒冷等环境因素也是本病的诱因。对特殊人群的调查发现，固定的工作姿势及刻板式局部训练可诱发AS。
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