目前针对丙肝的治疗效果较好。目前有专门针对丙肝的抗病毒类药物，不同于乙肝抗病毒药物，丙肝抗病毒药物能够对丙肝进行根除，能够将病因完整根除，治疗效果相对较好，根除概率可以达到95%以上。目前比较实用的全基因型是吉三代，吉三代针对丙肝的治疗效果比较全面，而且能够针对很多基因型的丙肝进行清除，所以也是丙肝治疗效果良好的重要原因。
另外丙肝要早期治疗，因为如果丙肝持续时间长，引起肝纤维化、肝硬化，甚至引起严重的肝硬化，此时再进行治疗效果就不是特别好，因为严重的肝硬化无法逆转，甚至还会持续进展。所以要在肝硬化没有出现之前，或者早期肝硬化的情况下，针对丙肝的病因及时根除，预后较好。
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