再生障碍性贫血的治疗可以分为一般治疗和促造血治疗。
一、一般治疗主要包括以下几个方面；1:清除可能的致病因素，如长期苯的接触、乙肝病毒感染等；2:给予输血支持治疗：输注红细胞，防止贫血过重导致呼吸循环功能异常；给予血小板的输注，防止危及生命的出血；3:感染的治疗和预防，给予合理的抗生素使用，必要时对病人提供全环境保护。
二、促造血治疗，需要进行分型治疗。
对于重型再障，尤其是急性重型再障年轻患者，如果有合适的供者优先选择造血干细胞移植治疗；对于年龄偏大或没有合适供者的年轻病人，则首选抗淋巴细胞球蛋白、或者抗胸腺细胞球蛋白进行免疫抑制治疗；对于不同分型的再障患者均需要长程应用环孢素等药物治疗，同时可合并应用雄性激素，帮助改善血象；加用造血因子：如促血小板生成素、粒细胞集落刺激因子等可以提升血细胞，减少感染的发生率；还可以联合传统的中医中药治疗等。
重要的是对再障必须进行分型治疗，而病人则需要坚持长期用药，另外早期诊断，早期治疗也是急性重型再障获得生存的最重要的一个方面。
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