解脲支原体感染的常用治疗方式是抗菌素治疗，常用抗菌素主要有大环内酯类抗菌素，比如阿奇霉素、罗红霉素或者红霉素，其他少见抗菌素，如米诺环素等。上述抗菌素对支原体的感染比较敏感，用药效果较好。
但少数支原体会对其中一类或部分药物耐药，需要针对支原体进行培养或进行药物细菌敏感性试验。根据药敏试验的结果选择敏感抗菌素治疗，明确何类大环内酯类抗菌素或者具体何种药物，对解脲支原体有效，然后再选择敏感抗菌素。
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