婴儿黄疸在照射蓝光过程中，通常不存在危害，但是会有不良反应。如果有明显黄疸的情况下，胆红素水平较高，最安全有效的退黄方式是蓝光照射。在蓝光照射的过程中，可能会出现一过性不良反应，比如发热。有些婴儿会因为胆红素代谢物质对肠道刺激，而导致腹泻，也可能会出现皮疹、青铜症，皮肤如同青铜一样偏绿。多数婴儿的不良反应，均在照射蓝光的过程中出现，一旦蓝光照射停止，相关不良反应会很快自行恢复，所以没有太大影响。
因此从家长的角度，对于照射蓝光无需特别担心，不会出现晒坏等情况。对于蓝光照射的远期影响，目前研究发现，可能会有DNA损伤等，目前仍没有定论，没有明确证据证明蓝光照射对身体有决定性影响。但是蓝光照射会对视网膜或者生殖器产生一定影响，在蓝光照射的过程中，均会进行眼睛遮挡和生殖器遮挡，只要有所遮挡，均不会有太大影响。
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