偏头痛患者先要检查一下颅脑CT或者颅脑核磁，排除颅内器质性病变。常见的疾病主要包括脑出血、脑梗死、脑炎、颅脑外伤、颅脑肿瘤、脑寄生虫感染等，必要时检查副鼻窦CT，以排除副鼻窦炎所引起。如果患者有中耳炎和牙龈炎，也可能会出现偏头痛，必要时检查血常规，必要的情况下应到耳鼻喉科或者口腔科进行诊治。患者有颈椎病史也可能会出现偏头痛，主要是检查颈椎核磁或者颈椎CT以明确诊断。如果患者有原发性神经痛也可引起，主要是根据患者的症状、体征和病史来加以诊断。如果是原发性头痛疾病，比如偏头痛和丛集性头痛也可以出现，确切的病因尚不明确，主要是根据病史、症状、体征诊断。
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