耐药肺结核主要是对于抗结核药物有一种或者一种以上，甚至更多种药物产生耐受性的特殊类型的肺结核，这些药物对于结核杆菌不敏感，甚至没有任何抑制或者杀灭作用。根据患者是否接受过抗结核药物治疗，可分为原发性耐药肺结核、获得性耐药肺结核；根据结核病情的严重程度，可分为耐药肺结核、耐多药肺结核、广泛耐药性肺结核。发生耐药肺结核的主要原因是在自然肺结核菌群中，天然存在有少量的耐药变异菌，以及不规范的治疗或者使用过于单一的抗结核药物治疗而导致。
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