莫西沙星和头孢是两种不同的抗生素，从抗菌谱、药理作用方面都有不同。首先头孢类分为一代到四代，一共有四大类头孢菌素，这四代头孢菌素对于抗菌谱、不良反应方面都有一些差别，比如一代头孢更多对阳性菌感染效果比较好，三代头孢对阴性菌感染效果比较好，四代头孢是广谱抗菌药物，对阳性菌、阴性菌感染都有效果。莫西沙星是喹诺酮类抗生素，和头孢类不一样，莫西沙星是广谱抗生素，对阳性菌、阴性菌都有比较好的抗菌活性，对厌氧菌或者支原体、衣原体效果也比较好。
除此之外，莫西沙星和头孢相比不良反应方面也有一些差别，比如对于肾功能的影响，头孢类对肾功能影响比较大，莫西沙星对肾功能影响可比较小，即使患者既往有肾功能不全，使用莫西沙星时也不需要调整剂量。总之，头孢和莫西沙星分属不同抗菌素类别，在抗菌活性、不良反应方面都有比较大的区别。
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