对于儿童先天性心脏病多数情况下与妈妈在怀孕期间受到了病毒感染有一定的关系，特别是风疹病毒、流行性感冒病毒、流行性腮腺炎、病毒、科萨奇病毒等等。
当然如果妈妈在怀孕期间缺乏叶酸，接触了放射线，服用了一些药物，特别是抗肿瘤、抗癫痫的药物以及抗代谢病类的药物，都可能导致先天性心脏病的发生。
如果家族中存在先天性心脏病的遗传基因或者说出现了染色体的异常，也会导致先天性心脏病发生。
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