多囊肾是一种常染色体显性遗传性疾病，如果父母一方有这个毛病，子女发病概率50%，所以这是一种与基因有关的疾病，很难以治疗。
目前医学上能用于治疗的方法很少，主要在于控制其并发症，比如说患者出现泌尿系统感染的时候，给予抗炎；出现囊肿破裂出血的时候，给予止血。
目前临床上有一些抑制肿生长的药物，正在临床研究过程中，比如雷帕霉素。
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