如果病人的临床表现及胸部影像学高度怀疑肺结核，可以行痰找抗酸杆菌，可以连续三天行痰找抗酸杆菌。如果痰中找到抗酸杆菌，可以确诊肺结核。如果在痰中找不到抗酸杆菌，还可以行支气管镜检查，在气管镜下吸痰行痰找抗酸杆菌。如果是肺内没有痰，可以行肺泡灌洗，在肺泡灌洗液中找抗酸杆菌。如果在支气管镜下吸的痰中或肺泡灌洗液中找到抗酸杆菌，可以确诊肺结核。如果上述方法均找不到抗酸杆菌，还可以行CT引导下肺穿刺，根据病理上结核的典型改变也可以确诊肺结核。
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