EB病毒与鼻咽癌具有密切相关性。通常EB病毒检查五项，最重要的为前三项，包括病毒早期抗原、EB病毒核心抗原、EB病毒衣壳抗原。EB病毒核心抗原发生于感染3-4个月，长期携带仅可证实患者曾感染过EB病毒。EB病毒早期两个毒蛋白，即Rta和Zta，证明病毒在体内存在。EB病毒核心抗体在感染3-4周后陆续出现，但抗体终身携带，仅证明患者曾感染过，既往具有EB病毒感染史。EB病毒早期抗原和EB病毒衣壳抗原，可作为EB病毒辅助诊断标志。
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