当前没有充分证据能说明新型冠状病毒的确切来源。已知它是一种动物源性病毒，在武汉发现的早期病例被认为是通过动物传染给人类的，但截至3月上旬尚未查明动物来源。新型冠状病毒与蝙蝠携带的冠状病毒亲源关系最近，同源性可达96%，推断蝙蝠可能是该病毒的宿主。但由于蝙蝠直接传给人的概率极低，大概存在病毒的中间宿主，但中间宿主也尚未查明。病毒溯源是疫情防治的核心工作之一，目的是找到病毒传染源头，摸清病毒初始传播途径、突变规律和潜在风险，从病毒源头为疫情防控提供重要的科学依据。目前由于不清楚新型冠状病毒的动物来源，但是全世界的科学家都在研究这一重要课题，相信不久的将来可能会得到答案。
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