胶囊胃镜跟胃镜相比它的优点就是痛苦非常小，因为摄入胶囊以后，胶囊上有摄像头，帮助我们连续拍片从而来识别胃部有没有病变，所以它的痛苦较胃镜，特别是普通胃镜来说是非常小的。但胶囊胃镜与普通胃镜相比，它有它的局限性：
一、胶囊胃镜对食管的观察是有限的，尤其对食管胃结合处的贲门的观察是非常受限。而现在贲门癌在胃癌的发病率中越来越高，所以这部分很容易导致漏诊，然而做胃镜是常规的要在这边细致观察。所以胃镜跟胶囊胃镜相比，胃镜可能更容易发现病变。
二、胶囊胃镜受胃内黏液的影响非常大，如果一旦胃内有大量的黏液或者食物残渣，可以导致整个画面的影响，从而影响观察，甚至可以漏掉一些疾病。而胃镜由于它的冲洗和吸引的作用，如果胃内有一些黏液或食物残渣，有可能能够去除，从而进一步观察到病变。
三、胶囊胃镜它的操作与整个操作者有密切的关系，因为胶囊胃镜在操作的过程中是操作体外的磁场，从而来帮助我们使胶囊运动，观察到某一个部位，但一旦操作者对胶囊的控制不好，有可能就会导致病变漏掉，这个部位观察的受限，从而不能很好发现病变。而胃镜的检查相对来说，因为总体来说做胃镜的大夫对每一个部位的观察可能都是规范培训的，所以没有胶囊的这种对操作者的要求还是有所不同的。
四、胶囊胃镜的局限点就是它不能取活检，如果是发现了胃部病变，胃镜可以取活检判断良恶性，而胶囊胃镜是不可以的。
所以总体而言，如果患者的身体情况允许的话，还是建议做胃镜可能更加清楚，而且能帮助我们取活检。但是如果在特殊的情况下，胶囊胃镜还是有它自己的特殊的意义。
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